skimage.data#

サンプル画像とデータセット。

テスト、例、ドキュメントで使用される、厳選された汎用および科学画像セットです。

新しいデータセットは、パッケージの一部として含まれなくなりましたが、オンデマンドでダウンロードされます。データをオフラインで利用できるようにするには、download_all()を使用してください。

astronaut

宇宙飛行士アイリーン・コリンズのカラー画像。

binary_blobs

いくつかの丸みを帯びたブロブ状のオブジェクトを持つ合成バイナリ画像を生成します。

brain

ノースカロライナ大学のボリュームレンダリングテストデータセットからのデータのサブセット。

brick

レンガの壁。

camera

グレーレベルの「カメラ」画像。

cat

猫のチェルシー。

cell

生理食塩水に浮遊する細胞。

cells3d

細胞の3D蛍光顕微鏡画像。

checkerboard

チェッカーボード画像。

chelsea

猫のチェルシー。

clock

モーションブラーがかかった時計。

coffee

コーヒーカップ。

coins

ポンペイのギリシャのコイン。

colorwheel

カラーホイール。

download_all

scikit-imageをオフラインで使用するために、すべてのデータセットをダウンロードします。

eagle

イヌワシ。

file_hash

指定されたファイルのハッシュを計算します。

grass

草。

gravel

砂利

horse

馬の白黒シルエット。

hubble_deep_field

ハッブルエクストリームディープフィールド。

human_mitosis

有糸分裂中のヒト細胞の画像。

immunohistochemistry

ヘマトキシリン対比染色による免疫組織化学(IHC)染色。

kidney

マウスの腎臓組織。

lbp_frontal_face_cascade_filename

弱い分類器カスケードを含むXMLファイルへのパスを返します。

lfw_subset

LFWデータセットからのデータのサブセット。

lily

スズランの植物の茎。

logo

Scikit-imageのロゴ、RGBA画像。

microaneurysms

グレーレベルの「マイクロアニュリズム」画像。

moon

月の表面。

nickel_solidification

ニッケル合金サンプルの急速な凝固を示すシンクロトロンX線写真の画像シーケンス。

page

スキャンされたページ。

palisades_of_vogt

フォークトの柵を示す生体組織の画像シーケンスを返します。

protein_transport

細胞質領域から核膜に再局在化するタンパク質の蛍光タグ付き顕微鏡画像シーケンス。

retina

人間の網膜。

rocket

SpaceXによるFalcon 9でのDSCOVRの打ち上げ写真。

shepp_logan_phantom

シェップ・ローガンファントム。

skin

真皮と表皮(皮膚層)の顕微鏡画像。

stereo_motorcycle

グランドトゥルース視差を持つ修正されたステレオ画像ペア。

text

コーナー検出に使用されるグレーレベルの「テキスト」画像。

vortex

最初のPIVチャレンジからのケースB1画像ペア。


skimage.data.astronaut()[ソース]#

宇宙飛行士アイリーン・コリンズのカラー画像。

アメリカの宇宙飛行士、アイリーン・コリンズの写真。彼女は1992年に宇宙飛行士に選ばれ、1995年に最初にスペースシャトルSTS-63を操縦しました。彼女は宇宙空間で合計38日8時間10分を過ごした後、2006年に引退しました。

この画像は、NASAのグレートイメージデータベース <https://flic.kr/p/r9qvLn>`__からダウンロードされました。

既知の著作権制限はなく、パブリックドメインにリリースされています。

戻り値:
astronaut(512, 512, 3) uint8 ndarray

宇宙飛行士の画像。

汎用画像

汎用画像

画像/配列のブロックビュー

画像/配列のブロックビュー

RGBからグレースケール

RGBからグレースケール

RGB画像へのグレースケールフィルターの適用

RGB画像へのグレースケールフィルターの適用

アクティブ輪郭モデル

アクティブ輪郭モデル

リスケール、サイズ変更、縮小

リスケール、サイズ変更、縮小

画像ピラミッドの構築

画像ピラミッドの構築

区分的アフィン変換

区分的アフィン変換

画像デコンボリューション

画像デコンボリューション

画像での窓関数の使用

画像での窓関数の使用

画像デコンボリューション

画像デコンボリューション

ぼかしの強さの推定

ぼかしの強さの推定

インペインティングによる欠陥の補完

インペインティングによる欠陥の補完

テクスチャを維持するための非局所平均ノイズ除去

テクスチャを維持するための非局所平均ノイズ除去

方向勾配のヒストグラム

方向勾配のヒストグラム

CENSURE特徴検出器

CENSURE特徴検出器

ORB特徴検出器とバイナリ記述子

ORB特徴検出器とバイナリ記述子

画像からのガボール/一次視覚野の「単純細胞」

画像からのガボール/一次視覚野の「単純細胞」

BRIEFバイナリ記述子

BRIEFバイナリ記述子

SIFT特徴検出器と記述子抽出器

SIFT特徴検出器と記述子抽出器

セグメンテーションアルゴリズムとスーパーピクセルアルゴリズムの比較

セグメンテーションアルゴリズムとスーパーピクセルアルゴリズムの比較

フラッドフィル

フラッドフィル

カスケード分類器を使用した顔検出

カスケード分類器を使用した顔検出

skimage.data.binary_blobs(length=512, blob_size_fraction=0.1, n_dim=2, volume_fraction=0.5, rng=None)[ソース]#

いくつかの丸みを帯びたブロブ状のオブジェクトを持つ合成バイナリ画像を生成します。

パラメーター:
lengthint, optional

出力画像の線形サイズ。

blob_size_fractionfloat, optional

lengthの割合としてのブロブの典型的な線形サイズ。1より小さくする必要があります。

n_dimint, optional

出力画像の次元数。

volume_fractionfloat, default 0.5

ブロブで覆われた画像ピクセルの割合(出力が1の場合)。[0, 1]にする必要があります。

rng{numpy.random.Generator, int}, optional

疑似乱数ジェネレーター。デフォルトでは、PCG64ジェネレーターが使用されます(numpy.random.default_rng()を参照)。rngがintの場合、ジェネレーターのシードに使用されます。

戻り値:
blobsbool型のndarray

出力バイナリ画像

>>> from skimage import data
>>> data.binary_blobs(length=5, blob_size_fraction=0.2)  
array([[ True, False,  True,  True,  True],
       [ True,  True,  True, False,  True],
       [False,  True, False,  True,  True],
       [ True, False, False,  True,  True],
       [ True, False, False, False,  True]])
>>> blobs = data.binary_blobs(length=256, blob_size_fraction=0.1)
>>> # Finer structures
>>> blobs = data.binary_blobs(length=256, blob_size_fraction=0.05)
>>> # Blobs cover a smaller volume fraction of the image
>>> blobs = data.binary_blobs(length=256, volume_fraction=0.3)

汎用画像

汎用画像

スケルトン化

スケルトン化

ランダムウォーカーセグメンテーション

ランダムウォーカーセグメンテーション

pandasを使用した領域プロパティの調査と視覚化

pandasを使用した領域プロパティの調査と視覚化

コロケーションメトリクス

コロケーションメトリクス

skimage.data.brain()[ソース]#

ノースカロライナ大学のボリュームレンダリングテストデータセットからのデータのサブセット。

完全なデータセットは[1]で入手できます。

戻り値:
image(10, 256, 256) uint16 ndarray

注釈

3Dボリュームは、より大きなボリュームからの10個のレイヤーで構成されています。

参考文献

ローカルヒストグラム均等化

ローカルヒストグラム均等化

ランクフィルター

ランクフィルター

skimage.data.brick()[ソース]#

レンガの壁。

戻り値:
brick(512, 512) uint8 画像

レンガの壁の小さなセクション。

注釈

元の画像はCC0Texturesからダウンロードされ、クリエイティブコモンズCC0ライセンスの下でライセンスされています。

次に、画像に遠近変換が適用され、その後、画像を90度回転させてから、トリミングとスケーリングを行って最終的な画像を取得しました。

汎用画像

汎用画像

テクスチャ分類のためのガボールフィルターバンク

テクスチャ分類のためのガボールフィルターバンク

テクスチャ分類のためのローカルバイナリパターン

テクスチャ分類のためのローカルバイナリパターン

skimage.data.camera()[ソース]#

グレーレベルの「カメラ」画像。

セグメンテーションとノイズ除去の例に使用できます。

戻り値:
camera(512, 512) uint8 ndarray

カメラ画像。

注釈

著作権制限はありません。写真家(Lav Varshney)によるCC0。

バージョン0.18で変更: 著作権制限により、この画像が置き換えられました。詳細については、[1]を参照してください。

参考文献

汎用画像

汎用画像

画像操作のための単純なNumPy演算の使用

画像操作のための単純なNumPy演算の使用

グレースケール画像の着色

グレースケール画像の着色

直線ハフ変換

直線ハフ変換

エッジオペレーター

エッジオペレーター

構造類似性指標

構造類似性指標

画像登録

画像登録

マスクされた正規化相互相関

マスクされた正規化相互相関

エントロピー

エントロピー

ガウス差によるバンドパスフィルタリング

ガウス差によるバンドパスフィルタリング

バターワースフィルター

バターワースフィルター

高密度 DAISY 特徴量の説明

高密度 DAISY 特徴量の説明

GLCM テクスチャ特徴

GLCM テクスチャ特徴

閾値処理

閾値処理

Chan-Vese セグメンテーション

Chan-Vese セグメンテーション

Multi-Otsu 閾値処理

Multi-Otsu 閾値処理

モルフォロジカルスネーク

モルフォロジカルスネーク

フラッドフィル

フラッドフィル

閾値処理

閾値処理

ランクフィルター

ランクフィルター

Li の閾値処理

Li の閾値処理

skimage.data.cat()[ソース]#

猫のチェルシー。

テクスチャ、水平方向と斜め方向に顕著なエッジ、および異なるスケールの特徴を持つ例。

戻り値:
chelsea(300, 451, 3) uint8 ndarray

チェルシー画像。

注釈

著作権による制限はありません。写真家 (Stefan van der Walt) による CC0。

汎用画像

汎用画像

画像にテキストをレンダリングする

画像にテキストをレンダリングする

skimage.data.cell()[ソース]#

生理食塩水に浮遊する細胞。

これは、Python ライブラリ qpformat を使用してデジタルホログラムから取得した定量位相画像です。画像は、背景位相よりも高い位相値を持つ細胞を示しています。

背景に縞模様のアーティファクトがあるため、この画像は閾値処理アルゴリズムの良いテストになります。ピクセル間隔は 0.107 µm です。

これらのデータは、[1] の一部として、球形オブジェクトに対するいくつかの屈折率取得手法間の比較の一部でした。

この画像は CC0 であり、パブリックドメインに捧げられています。許可を求めることなく、コピー、変更、または配布することができます。

戻り値:
cell(660, 550) uint8 array

細胞の画像。

参考文献

[1]

Paul Müller, Mirjam Schürmann, Salvatore Girardo, Gheorghe Cojoc, および Jochen Guck. 「定量位相イメージングにおける球形オブジェクトのサイズと屈折率の正確な評価」。Optics Express 26(8): 10729-10743 (2018)。 DOI:10.1364/OE.26.010729

Li の閾値処理

Li の閾値処理

skimage.data.cells3d()[ソース]#

細胞の3D蛍光顕微鏡画像。

返されるデータは、(z, c, y, x) の順で寸法が指定された 3D マルチチャネル配列です。各ボクセルのサイズは (0.29 0.26 0.26) マイクロメートルです。チャネル 0 には細胞膜、チャネル 1 には核が含まれています。

戻り値:
cells3d: (60, 2, 256, 256) uint16 ndarray

光学顕微鏡で撮影された細胞の体積画像。

注釈

このデータは、アレン細胞科学研究所によって提供されました。

計算時間を短縮するために、行と列の寸法で 4 分の 1 にダウンサンプリングされています。

顕微鏡は、次のボクセル間隔をマイクロ単位で報告しています

  • 元のボクセルサイズは (0.290, 0.065, 0.065) です。

  • 各次元のスケーリングファクターは (1, 4, 4) です。

  • リサイズ後のボクセルサイズは (0.29 0.26 0.26) です。

3つ以上の空間次元を持つデータセット

3つ以上の空間次元を持つデータセット

3D 適応ヒストグラム平坦化

3D 適応ヒストグラム平坦化

背景強度を推定するためにローリングボールアルゴリズムを使用する

背景強度を推定するためにローリングボールアルゴリズムを使用する

(細胞の)3D 画像を探索する

(細胞の)3D 画像を探索する

skimage.data.checkerboard()[ソース]#

チェッカーボード画像。

チェッカーボードは、コーナーポイントを簡単に見つけることができるため、画像キャリブレーションでよく使用されます。多くの平行エッジがあるため、歪みを特にうまく視覚化することもできます。

戻り値:
checkerboard(200, 200) uint8 ndarray

チェッカーボード画像。

汎用画像

汎用画像

画像ワーピングに薄板スプラインを使用する

画像ワーピングに薄板スプラインを使用する

RANSAC を使用した堅牢なマッチング

RANSAC を使用した堅牢なマッチング

コーナー検出

コーナー検出

フラッドフィル

フラッドフィル

skimage.data.chelsea()[ソース]#

猫のチェルシー。

テクスチャ、水平方向と斜め方向に顕著なエッジ、および異なるスケールの特徴を持つ例。

戻り値:
chelsea(300, 451, 3) uint8 ndarray

チェルシー画像。

注釈

著作権による制限はありません。写真家 (Stefan van der Walt) による CC0。

ヒストグラムマッチング

ヒストグラムマッチング

ホモグラフィの種類

ホモグラフィの種類

J-不変性を用いたノイズ除去器のキャリブレーション

J-不変性を用いたノイズ除去器のキャリブレーション

画像のノイズ除去

画像のノイズ除去

シフト不変ウェーブレットノイズ除去

シフト不変ウェーブレットノイズ除去

位相アンラッピング

位相アンラッピング

ウェーブレットノイズ除去

ウェーブレットノイズ除去

J-不変性を用いたノイズ除去器のキャリブレーションに関する完全なチュートリアル

J-不変性を用いたノイズ除去器のキャリブレーションに関する完全なチュートリアル

フラッドフィル

フラッドフィル

skimage.data.clock()[ソース]#

モーションブラーがかかった時計。

この壁掛け時計の写真は、カメラをほぼ水平方向に動かしながら撮影されました。逆フィルタとデコンボリューションを示すために使用できます。

写真家 (Stefan van der Walt) によってパブリックドメインにリリースされました。

戻り値:
clock(300, 400) uint8 ndarray

時計の画像。

汎用画像

汎用画像

skimage.data.coffee()[ソース]#

コーヒーカップ。

この写真は、ピコロエスプレッソバーのご厚意によるものです。いくつかの楕円形と、さまざまなテクスチャ(滑らかな磁器から粗い木目まで)が含まれています。

戻り値:
coffee(400, 600, 3) uint8 ndarray

コーヒーの画像。

注釈

著作権による制限はありません。写真家 (Rachel Michetti) による CC0。

RGB から HSV へ

RGB から HSV へ

ヒストグラムマッチング

ヒストグラムマッチング

円形および楕円形ハフ変換

円形および楕円形ハフ変換

領域境界ベースの領域隣接グラフ (RAG)

領域境界ベースの領域隣接グラフ (RAG)

領域隣接グラフ (RAG) 閾値処理

領域隣接グラフ (RAG) 閾値処理

正規化カット

正規化カット

領域隣接グラフ (RAG) の描画

領域隣接グラフ (RAG) の描画

領域隣接グラフ (RAG) のマージ

領域隣接グラフ (RAG) のマージ

領域境界 RAG の階層的マージ

領域境界 RAG の階層的マージ

skimage.data.coins()[ソース]#

ポンペイのギリシャのコイン。

この画像は、灰色の背景に対してアウトラインが描かれた複数のコインを示しています。特に、背景に対して個々のオブジェクトを識別する必要がある、セグメンテーションテストなどで役立ちます。背景は、単純なセグメンテーションだけでは不十分なほど、コインと十分なグレーレベルを共有しています。

戻り値:
coins(303, 384) uint8 ndarray

コインの画像。

注釈

この画像は、ブルックリン美術館コレクションからダウンロードしました。

既知の著作権による制限はありません。

局所最大値のフィルタリング

局所最大値のフィルタリング

円形および楕円形ハフ変換

円形および楕円形ハフ変換

ヒステリシス閾値処理

ヒステリシス閾値処理

平均フィルタ

平均フィルタ

テンプレートマッチング

テンプレートマッチング

テクスチャ分類のためのマルチブロック局所二値パターン

テクスチャ分類のためのマルチブロック局所二値パターン

スライディングウィンドウヒストグラム

スライディングウィンドウヒストグラム

コンパクトなウォーターシェッドを使用した規則的なセグメントの検索

コンパクトなウォーターシェッドを使用した規則的なセグメントの検索

局所最大値の検索

局所最大値の検索

重複なしでセグメンテーションラベルを拡張する

重複なしでセグメンテーションラベルを拡張する

画像領域にラベルを付ける

画像領域にラベルを付ける

2つのセグメンテーションの交点を見つける

2つのセグメンテーションの交点を見つける

モルフォロジカルスネーク

モルフォロジカルスネーク

領域のプロパティを測定する

領域のプロパティを測定する

セグメンテーションメトリックの評価

セグメンテーションメトリックの評価

背景強度を推定するためにローリングボールアルゴリズムを使用する

背景強度を推定するためにローリングボールアルゴリズムを使用する

視覚的な画像比較

視覚的な画像比較

エッジベースのセグメンテーションと領域ベースのセグメンテーションの比較

エッジベースのセグメンテーションと領域ベースのセグメンテーションの比較

skimage.data.colorwheel()[ソース]#

カラーホイール。

戻り値:
colorwheel(370, 371, 3) uint8 image

カラーホイール。

汎用画像

汎用画像

skimage.data.download_all(directory=None)[ソース]#

scikit-imageをオフラインで使用するために、すべてのデータセットをダウンロードします。

Scikit-image のデータセットは、デフォルトではライブラリに同梱されなくなりました。これにより、ライブラリのダウンロードサイズを小さく保ちながら、より高品質なデータセットを使用できます。

この関数は、完全なデータセットをダウンロードするために、オプションの依存関係である pooch のインストールが必要です。次の場所にあるインストール手順に従ってください

この関数を呼び出して、すべてのサンプル画像をダウンロードし、マシンでオフラインで使用できるようにします。

パラメーター:
directory: パスのようなもの、オプション

データセットを保存するディレクトリ。

Raises:
ModuleNotFoundError

pooch がインストールされていない場合、このエラーが発生します。

注釈

scikit-image は、デフォルトのディレクトリに保存されている画像のみを検索します。特定の理由で自分のフォルダに画像をダウンロードしたい場合にのみ、ディレクトリを指定してください。変数 skimage.data.data_dir を調べることで、デフォルトのデータディレクトリの場所を確認できます。


skimage.data.eagle()[ソース]#

イヌワシ。

セグメンテーション、ハフ変換、コーナー検出の例に適しています。

戻り値:
eagle(2019, 1826) uint8 ndarray

ワシの画像。

注釈

著作権による制限はありません。写真家 (Dayane Machado) による CC0。

ウォーターシェッド変換のマーカー

ウォーターシェッド変換のマーカー

skimage.data.file_hash(fname, alg='sha256')[ソース]#

指定されたファイルのハッシュを計算します。

ファイルが変更または破損したかどうかを確認するのに役立ちます。

パラメーター:
fnamestr

ファイル名。

algstr

ハッシュアルゴリズムの種類

戻り値:
hashstr

ファイルのハッシュ値。

>>> fname = "test-file-for-hash.txt"
>>> with open(fname, "w") as f:
...     __ = f.write("content of the file")
>>> print(file_hash(fname))
0fc74468e6a9a829f103d069aeb2bb4f8646bad58bf146bb0e3379b759ec4a00
>>> import os
>>> os.remove(fname)

skimage.data.grass()[ソース]#

草。

戻り値:
grass(512, 512) uint8 画像

草の画像。

注釈

オリジナルの画像はDeviantArtからダウンロードされ、クリエイティブ・コモンズCC0ライセンスの下でライセンスされています。

ダウンロードされた画像は、左上隅を中心とした(512, 512)ピクセルの領域を含むように切り抜かれ、グレースケールに変換され、その後uint8に変換されてから、結果がPNG形式で保存されました。

テクスチャ分類のためのガボールフィルターバンク

テクスチャ分類のためのガボールフィルターバンク

テクスチャ分類のためのローカルバイナリパターン

テクスチャ分類のためのローカルバイナリパターン

skimage.data.gravel()[ソース]#

砂利

戻り値:
gravel(512, 512) uint8 画像

グレースケールの砂利のサンプル。

注釈

オリジナルの画像はCC0Texturesからダウンロードされ、クリエイティブ・コモンズCC0ライセンスの下でライセンスされています。

ダウンロードされた画像は、(1024, 1024)にリスケールされ、その後左上の(512, 512)ピクセル領域が切り抜かれた後、画像がグレースケールおよびuint8データ型に変換されました。結果はPNG形式を使用して保存されました。

ガウス差によるバンドパスフィルタリング

ガウス差によるバンドパスフィルタリング

テクスチャ分類のためのガボールフィルターバンク

テクスチャ分類のためのガボールフィルターバンク

テクスチャ分類のためのローカルバイナリパターン

テクスチャ分類のためのローカルバイナリパターン

skimage.data.horse()[ソース]#

馬の白黒シルエット。

この画像はopenclipartからダウンロードされました

著作権による制限はありません。所有者(Andreas Preuss(marauder))によるCC0。

戻り値:
horse(328, 400) bool ndarray

馬の画像。

凸包

凸包

スケルトン化

スケルトン化

形態学的フィルタリング

形態学的フィルタリング

skimage.data.hubble_deep_field()[ソース]#

ハッブルエクストリームディープフィールド。

この写真は、ハッブル宇宙望遠鏡が撮影した宇宙の最も遠い景色を含んでいます。マルチスケール検出の例として役立つ可能性があります。

戻り値:
hubble_deep_field(872, 1000, 3) uint8 ndarray

ハッブルディープフィールド画像。

注釈

この画像はHubbleSiteからダウンロードされました。

画像はNASAによって撮影され、パブリックドメインで自由に使用できます

科学画像

科学画像

トップハットフィルターを使用して、グレースケール画像内の小さなオブジェクトを削除する

トップハットフィルターを使用して、グレースケール画像内の小さなオブジェクトを削除する

J-不変性を用いたノイズ除去器のキャリブレーションに関する完全なチュートリアル

J-不変性を用いたノイズ除去器のキャリブレーションに関する完全なチュートリアル

オブジェクトの削除

オブジェクトの削除

ブロブ検出

ブロブ検出

極値

極値

skimage.data.human_mitosis()[ソース]#

有糸分裂中のヒト細胞の画像。

戻り値:
human_mitosis: (512, 512) uint8 ndarray

[1]の原稿の準備中に撮影された、有糸分裂中のヒト細胞のデータ。

注釈

Copyright David Root。CC-0 [2]の下でライセンスされています。

参考文献

[1]

Moffat J, Grueneberg DA, Yang X, Kim SY, Kloepfer AM, Hinkle G, Piqani B, Eisenhaure TM, Luo B, Grenier JK, Carpenter AE, Foo SY, Stewart SA, Stockwell BR, Hacohen N, Hahn WC, Lander ES, Sabatini DM, Root DE (2006) A lentiviral RNAi library for human and mouse genes applied to an arrayed viral high-content screen. Cell, 124(6):1283-98 / :DOI: 10.1016/j.cell.2006.01.040 PMID 16564017

[2]

GitHubライセンスに関する議論 CellProfiler/examples#41

(有糸分裂中の)ヒト細胞をセグメント化する

(有糸分裂中の)ヒト細胞をセグメント化する

skimage.data.immunohistochemistry()[ソース]#

ヘマトキシリン対比染色による免疫組織化学(IHC)染色。

この画像は、FHL2タンパク質の免疫組織化学的発現がDABで明らかにされた結腸腺を示しています。ヘマトキシリン対比染色を適用して、組織の陰性部分を強調しています。

この画像は、顕微鏡および分子イメージングセンター(CMMI)で取得されました。

既知の著作権による制限はありません。

戻り値:
immunohistochemistry(512, 512, 3) uint8 ndarray

免疫組織化学画像。

科学画像

科学画像

免疫組織化学的染色における色の分離

免疫組織化学的染色における色の分離

マスクを適用するSLIC vs SLIC

マスクを適用するSLIC vs SLIC

skimage.data.kidney()[ソース]#

マウスの腎臓組織。

事前に準備されたスライド上のこの生体組織は、共焦点蛍光顕微鏡(ニコンC1倒立顕微鏡)で画像化されました。画像形状は(16、512、512、3)です。つまり、X-Yでは512x512ピクセル、Zでは16の画像スライス、3つのカラーチャネル(それぞれ450nm、515nm、および605nmの放出波長)です。実空間のボクセルサイズは、X-Yで1.24ミクロン、Zで1.25ミクロンです。データ型は、符号なし16ビット整数です。

戻り値:
kidney(16, 512, 512, 3) uint16 ndarray

腎臓の3Dマルチチャネル画像。

注釈

この画像は、2018年にモナソマイクロイメージングのジュヌビエーブバックリーによって取得されました。ライセンス:CC0

(腎臓組織の)3D画像とインタラクトする

(腎臓組織の)3D画像とインタラクトする

3D顕微鏡画像で異方性を推定する

3D顕微鏡画像で異方性を推定する

skimage.data.lbp_frontal_face_cascade_filename()[ソース]#

弱い分類器カスケードを含むXMLファイルへのパスを返します。

これらの分類器は、LBP機能を使用してトレーニングされました。ファイルはOpenCVリポジトリ[1]の一部です。

参考文献

[1]

OpenCV lbpcascadeトレーニング済みファイル opencv/opencv

カスケード分類器を使用した顔検出

カスケード分類器を使用した顔検出

skimage.data.lfw_subset()[ソース]#

LFWデータセットからのデータのサブセット。

このデータベースは、以下を含むLFWデータベースのサブセットです

  • 100個の顔

  • 100個の顔ではないもの

完全なデータセットは[2]で入手できます。

戻り値:
images(200, 25, 25) uint8 ndarray

最初の100枚の画像は顔で、それに続く100枚は顔ではありません。

注釈

顔はLFWデータセットからランダムに選択され、顔ではないものは同じデータセットの背景から抽出されました。切り抜かれたROIは、25 x 25ピクセルにサイズ変更されました。

参考文献

[1]

Huang, G., Mattar, M., Lee, H., & Learned-Miller, E. G. (2012). Learning to align from scratch. In Advances in Neural Information Processing Systems (pp. 764-772).

特定の画像

特定の画像

Haarのような特徴記述子を使用した顔分類

Haarのような特徴記述子を使用した顔分類

skimage.data.lily()[ソース]#

スズランの植物の茎。

事前に準備されたスライド上のこの植物の茎は、共焦点蛍光顕微鏡(ニコンC1倒立顕微鏡)で画像化されました。画像形状は(922、922、4)です。つまり、X-Yでは922x922ピクセルで、4つのカラーチャネルがあります。実空間のボクセルサイズは、X-Yで1.24ミクロンです。データ型は、符号なし16ビット整数です。

戻り値:
lily(922, 922, 4) uint16 ndarray

ユリの2Dマルチチャネル画像。

注釈

この画像は、2018年にモナソマイクロイメージングのジュヌビエーブバックリーによって取得されました。ライセンス:CC0

科学画像

科学画像

Scikit-imageのロゴ、RGBA画像。

戻り値:
logo(500, 500, 4) uint8 ndarray

ロゴ画像。


skimage.data.microaneurysms()[ソース]#

グレーレベルの「微小動脈瘤」画像。

網膜(緑色チャネル)の画像からの詳細。画像は、高解像度眼底(HRF)画像データベースからの画像07_dr.JPGの切り抜きです:https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/

戻り値:
microaneurysms(102, 102) uint8 ndarray

病変のある網膜画像。

注釈

著作権による制限はありません。所有者(Andreas Maier)によるCC0。

参考文献

[1]

Budai, A., Bock, R, Maier, A., Hornegger, J., Michelson, G. (2013). Robust Vessel Segmentation in Fundus Images. International Journal of Biomedical Imaging, vol. 2013, 2013. DOI:10.1155/2013/154860

科学画像

科学画像

属性演算子

属性演算子

skimage.data.moon()[ソース]#

月の表面。

この低コントラストの月の表面の画像は、ヒストグラム平坦化とコントラスト強調を説明するのに役立ちます。

戻り値:
moon(512, 512) uint8 ndarray

月の画像。

科学画像

科学画像

ガンマおよびログコントラスト調整

ガンマおよびログコントラスト調整

ヒストグラム平坦化

ヒストグラム平坦化

ローカルヒストグラム均等化

ローカルヒストグラム均等化

簡単な画像ステッチで画像を組み立てる

簡単な画像ステッチで画像を組み立てる

アンシャープマスキング

アンシャープマスキング

穴埋めとピーク検出

穴埋めとピーク検出

skimage.data.nickel_solidification()[ソース]#

ニッケル合金サンプルの急速な凝固を示すシンクロトロンX線写真の画像シーケンス。

戻り値:
nickel_solidification: (11, 384, 512) uint16 ndarray

注釈

nickel_solidification.tif の情報については、scikit-image/data/-/blob/master/README.md#data を参照してください。

金属合金の凝固を追跡

金属合金の凝固を追跡

skimage.data.page()[ソース]#

スキャンされたページ。

印刷されたテキストのこの画像は、不均一な背景照明を必要とするデモンストレーションに役立ちます。

戻り値:
page(191, 384) uint8 ndarray

ページ画像。

属性演算子

属性演算子

閾値処理

閾値処理

ニブラックとソーボラの閾値処理

ニブラックとソーボラの閾値処理

背景強度を推定するためにローリングボールアルゴリズムを使用する

背景強度を推定するためにローリングボールアルゴリズムを使用する

閾値処理

閾値処理

ランクフィルター

ランクフィルター

skimage.data.palisades_of_vogt()[ソース]#

フォークトの柵を示す生体組織の画像シーケンスを返します。

人間の目では、フォークトの柵は角膜と強膜(すなわち、目の白目)の境界である角膜輪部の正常な特徴です。画像シーケンスでは、参照ミラー上の塵の存在により、いくつかの暗いスポットがあります。

戻り値:
palisades_of_vogt: (60, 1440, 1440) uint16 ndarray

注釈

in-vivo-cornea-spots.tif の情報については、scikit-image/data/-/blob/master/README.md#data を参照してください。

インペインティングによるスポットのある角膜画像の復元

インペインティングによるスポットのある角膜画像の復元

skimage.data.protein_transport()[ソース]#

細胞質領域から核膜に再局在化するタンパク質の蛍光タグ付き顕微鏡画像シーケンス。

戻り値:
protein_transport: (15, 2, 180, 183) uint8 ndarray

注釈

NPCsingleNucleus.tif の情報については、scikit-image/data/-/blob/master/README.md#data を参照してください。

コロケーションメトリクス

コロケーションメトリクス

核膜での蛍光強度を測定

核膜での蛍光強度を測定

skimage.data.retina()[ソース]#

人間の網膜。

網膜のこの画像は、円形の画像を必要とするデモンストレーションに役立ちます。

戻り値:
retina(1411, 1411, 3) uint8 ndarray

RGBの網膜画像。

注釈

この画像は、wikimedia からダウンロードされました。このファイルは、クリエイティブ・コモンズ CC0 1.0 ユニバーサル・パブリック・ドメイン・デディケーションの下で利用可能です。

参考文献

[1]

Häggström, Mikael (2014). “Medical gallery of Mikael Häggström 2014”. WikiJournal of Medicine 1 (2). DOI:10.15347/wjm/2014.008. ISSN 2002-4436. パブリックドメイン

科学画像

科学画像

リッジ演算子

リッジ演算子

レジストレーションのための極座標およびログ極座標変換の使用

レジストレーションのための極座標およびログ極座標変換の使用

ピクセルグラフを使用してオブジェクトの測地線中心を見つける

ピクセルグラフを使用してオブジェクトの測地線中心を見つける

skimage.data.rocket()[ソース]#

SpaceXによるFalcon 9でのDSCOVRの打ち上げ写真。

これは、フロリダ州ケープカナベラル空軍基地のSpaceXの打ち上げコンプレックス40から打ち上げられたDSCOVRを搭載したファルコン9の打ち上げ写真です。

戻り値:
rocket(427, 640, 3) uint8 ndarray

ロケット画像。

注釈

この画像は、SpaceX Photos からダウンロードされました。

この画像はSpaceXによって撮影され、パブリックドメインで公開されました


skimage.data.shepp_logan_phantom()[ソース]#

シェップ・ローガンファントム。

戻り値:
phantom(400, 400) float64 image

グレースケールでのシェップ・ローガンファントムの画像。

参考文献

[1]

L. A. Shepp and B. F. Logan, “The Fourier reconstruction of a head section,” in IEEE Transactions on Nuclear Science, vol. 21, no. 3, pp. 21-43, June 1974. DOI:10.1109/TNS.1974.6499235

科学画像

科学画像

ラドン変換

ラドン変換

形態学的フィルタリング

形態学的フィルタリング

skimage.data.skin()[ソース]#

真皮と表皮(皮膚層)の顕微鏡画像。

正常な表皮と真皮(良性の皮内母斑がある)の10倍のヘマトキシリンとエオシン染色スライド。

戻り値:
skin(960, 1280, 3) uint8 の RGB 画像

注釈

この画像は、最初に呼び出されたときにインターネット接続を必要とし、scikit-image データセットリポジトリから画像ファイルを取得するために pooch パッケージがインストールされている必要があります。

この画像のソースは https://en.wikipedia.org/wiki/File:Normal_Epidermis_and_Dermis_with_Intradermal_Nevus_10x.JPG です

画像は作者 Kilbad によってパブリックドメインで公開されました。

科学画像

科学画像

ローカル特徴とランダムフォレストを使用した学習可能なセグメンテーション

ローカル特徴とランダムフォレストを使用した学習可能なセグメンテーション

skimage.data.stereo_motorcycle()[ソース]#

グランドトゥルース視差を持つ修正されたステレオ画像ペア。

2つの画像は、左側の画像のすべてのピクセルが右側の画像の同じスキャンラインに対応するピクセルを持つように修正されています。これは、両方の画像が同じ向きを持つようにワープされているが、水平方向の空間オフセット(ベースライン)を持っていることを意味します。列方向のグラウンドトゥルースピクセルオフセットは、含まれている視差マップによって指定されます。

2つの画像は、Middlebury 2014ステレオベンチマークの一部です。このデータセットは、ミドルベリー大学のネラ・ネシック、ポーター・ウェストリング、王曦、北島洋、グレッグ・クラースウォール、ダニエル・シャースティンによって作成されました。取得プロセスの詳細については、[1] を参照してください。

ここに含まれる画像は、ベンチマークのデフォルト露出画像のダウンサンプリングされたバージョンです。画像は、関数skimage.transform.downscale_local_meanを使用して、4分の1の係数でダウンサンプリングされます。次のキャリブレーションデータと含まれているグラウンドトゥルース視差マップは、ダウンサンプリングされた画像に有効です

Focal length:           994.978px
Principal point x:      311.193px
Principal point y:      254.877px
Principal point dx:      31.086px
Baseline:               193.001mm
戻り値:
img_left(500, 741, 3) uint8 ndarray

左側のステレオ画像。

img_right(500, 741, 3) uint8 ndarray

右側のステレオ画像。

disp(500, 741, 3) float ndarray

グラウンドトゥルース視差マップ。各値は、左側のステレオ画像と右側のステレオ画像の対応するピクセル間の列方向のオフセットを記述します。たとえば、img_left[10, 10 + disp[10, 10]]に対応するピクセルは、img_right[10, 10]です。NaNは、左側の画像でグラウンドトゥルースを持たないピクセルを示します。

注釈

元の解像度の画像、露出と照明が異なる画像、およびグラウンドトゥルース深度マップは、ミドルベリーのウェブサイト [2] にあります。

参考文献

[1]

D. Scharstein, H. Hirschmueller, Y. Kitajima, G. Krathwohl, N. Nesic, X. Wang, and P. Westling. High-resolution stereo datasets with subpixel-accurate ground truth. In German Conference on Pattern Recognition (GCPR 2014), Muenster, Germany, September 2014.

特定の画像

特定の画像

基本行列推定

基本行列推定

オプティカルフローを使用したレジストレーション

オプティカルフローを使用したレジストレーション

skimage.data.text()[ソース]#

コーナー検出に使用されるグレースケール「テキスト」画像。

戻り値:
text(172, 448) uint8 ndarray

テキスト画像。

注釈

この画像は、Wikipedia からダウンロードされました <https://en.wikipedia.org/wiki/File:Corner.png>`__。

既知の著作権制限はなく、パブリックドメインにリリースされています。

アクティブ輪郭モデル

アクティブ輪郭モデル

幾何変換の使用

幾何変換の使用

skimage.data.vortex()[ソース]#

最初のPIVチャレンジからのケースB1画像ペア。

戻り値:
image0, image1(512, 512) グレースケール画像

合成の移動粒子を特徴とする画像のペア。

注釈

この画像は、PIVチャレンジサイトを管理している榊原淳教授に感謝の意を表し、著者である岡本浩司教授によってCC0としてライセンスされました。

参考文献

[1]

粒子画像流速計(PIV)チャレンジサイト http://pivchallenge.org

[2]

第1回PIVチャレンジ ケースB: http://pivchallenge.org/pub/index.html#b

特定の画像

特定の画像

オプティカルフローを使用したレジストレーション

オプティカルフローを使用したレジストレーション