scikit-image 0.21.0 (2023年6月2日)#

scikit-image 0.21.0 のリリースを発表できることを嬉しく思います！scikit-image は SciPy 用のイメージ処理ツールボックスであり、セグメンテーション、幾何学的変換、色空間操作、分析、フィルタリング、形態学、特徴検出などのアルゴリズムが含まれています。

詳細情報、例、ドキュメントについては、当社のウェブサイトをご覧ください。 https://scikit-image.dokyumento.jp

ハイライト#

Python 3.8 をサポートする最後のリリース
PRNG の統一された API

新機能#

scikit-image にフィッシャーベクトルを実装 (#5349).
AffineTransform に y 次元のせん断のサポートを追加 (#6752).

API の変更#

このリリースでは、擬似乱数を使用するアルゴリズムのシードの指定方法を統一しました。以前は、さまざまなキーワード引数（sample_seed、seed、random_seed、random_state）が異なる場所で同じ目的を果たしていました。これらはすべて、整数シードと NumPy ジェネレーターの両方を処理する単一の rng 引数に置き換えられました。関連する SciPy の議論と、引数を要約しようとする Scientific Python SPEC 7 を参照してください。

乱数シード/ジェネレーターのシードキーワードに関するAPIの統一 (#6258).
_invariant_denoise を denoise_invariant にリファクタリング (#6660).
公開APIでcolor.get_xyz_coordsを公開 (#6696).
join_segmentationsが、出力から入力ラベルへの配列マップを返すようにする (#6786).
擬似乱数のシードインターフェースの統一 (#6922).
幾何学的変換の逆変換をプロパティに変更 (#6926).

機能強化#

バウンディングボックスによるクロップ (#5499).
AffineTransform に y 次元のせん断のサポートを追加 (#6752).
join_segmentationsが、出力から入力ラベルへの配列マップを返すようにする (#6786).
regionpropsでspacingパラメータがタプルであるかを確認 (#6907).
dask配列でrescale_intensityの使用を有効化 (#6910).

パフォーマンス#

skimage.colorサブモジュールへの遅延読み込みの追加 (#6967).
skimage.drawサブモジュールへの遅延読み込みの追加 (#6971).
skimage.exposureへの遅延ローダーの追加 (#6978).
skimage.futureモジュールへの遅延読み込みの追加 (#6981).

バグ修正#

deprecatedデコレータをdeprecate_funcに修正およびリファクタリング (#6594).
_invariant_denoise を denoise_invariant にリファクタリング (#6660).
公開APIでcolor.get_xyz_coordsを公開 (#6696).
円または楕円をフィッティングする前にデータをシフトして正規化する (#6703).
pydata-sphinx-themeのショーケース (#6714).
AffineTransformのせん断角の行列計算を修正 (#6717).
threshold_li(): 単一値のバックグラウンドでlog(0)を防ぐ。(#6745).
footprints.diamondテストケースのコピーアンドペーストエラーを修正 (#6756).
.devpy/cmds.pyを最新のdevpyに合わせて更新 (#6789).
インストールガイドでcondaによるrtomlのインストールを避ける (#6792).
メソッドパラメータへの無効な値に対してskeletonizeでエラーを発生させる (#6805).
45度の向きを持つmeasure.regionpropsの向きに関する符号エラーを修正 (#6836).
segmentation.watershedの返されたデータ型を修正 (#6839).
transform.resizeでクリッピング時にNaNを処理する (#6852).
マルチチャネルプロパティのregionprop_tableの失敗を修正 (#6861).
64ビット整数の入力を許可しない; マスクされたモードとマスクされていないモードが揃っていることを確認するためのテストを追加する (#6875).
#6876で導入されたapply_parallelのタイプミスを修正 (#6881).
偶数次元のデータに対するLPIフィルターを修正 (#6883).
data_dirを作成せずにレガシーデータセットを使用する (#6886).
source_rangeが正しくない場合にエラーを発生させる (#6898).
centroid_weightedを計算するときにスペーシングのスケーリングを適用する (#6900).
Chan Veseのエネルギー計算を修正 (#6902).
area_openingのdocstringのDOIロールに欠けているバッククォートを追加 (#6913).
HTML出力へのrandom.jsの包含を修正 (#6935).
ランダムギャラリーリンクのURLを修正 (#6937).
urlopenバッファが確実に閉じられるようにコンテキストマネージャーを使用する (#6942).
skimage.graph._ncutのスパースインデックスタイプキャストを修正 (#6975).

メンテナンス#

deprecatedデコレータをdeprecate_funcに修正およびリファクタリング (#6594).
些細なransac呼び出しを許可する (#6755).
footprints.diamondテストケースのコピーアンドペーストエラーを修正 (#6756).
imageio v3 APIを使用する (#6764).
scipyの依存関係のアンピン (#6773).
.devpy/cmds.pyを最新のdevpyに合わせて更新 (#6789).
CLAHEコードをBSD-3-Clauseで再ライセンスする (#6795).
バグの問題テンプレートの再現セクションを緩和する (#6825).
devpyの名前をspinに変更する (#6842).
_supported_float_typeの呼び出しを修正することでthreshold_local関数の速度を向上させる (#6847).
ipywidgetsのカーネルを指定する (#6849).
data内のimage_fetcherとcreate_image_fetcherをプライベートにする (#6855).
古いdev.pyへの参照をspinで更新する (#6856).
0.21の削除を0.22にバンプする (#6868).
依存関係を更新する (#6869).
pre-commitsを更新する (#6870).
円形ファントムに対するラドン変換のテストを追加する (#6873).
64ビット整数の入力を許可しない; マスクされたモードとマスクされていないモードが揃っていることを確認するためのテストを追加する (#6875).
引数のデフォルト値として変更可能な型を使用しない (#6876).
version_switcher.jsonのURLを開発ドキュメントを指すようにする (#6882).
Mesonビルドの一部として削除された並列テストを追加する (#6884).
data_dirを作成せずにレガシーデータセットを使用する (#6886).
古いドキュメントの不要な部分を削除する (#6901).
一時的にimageioを<2.28にピン留めする (#6909).
擬似乱数のシードインターフェースの統一のフォローアップ (#6924).
カスタムコンテキストマネージャーの代わりにpytest.warnを使用する (#6931).
pydata-sphinx-themeへの移行のフォローアップ (#6933).
Cython 3に対応するため、関数をnoexceptとしてマークします（#6936）。
ransacのdocstringにある不安定なテストをスキップします（#6938）。
EllipseModelのフィッティングパラメータの安定性を向上させました（#6943）。
生成されたHTMLドキュメントのロゴをscikit-image.orgに修正しました（#6947）。
ユーザーがRNGを提供した場合、ディープコピーの前にそれを生成します（#6948）。
ransacのdoctestをスキップします（#6953）。
HTMLドキュメントでGeometricTransform.residualsを公開します（#6968）。
NumPy 1.25の非推奨警告を修正しました（#6969）。
JupyterLiteを元に戻しました（#6972）。
超越関数に関する問題のため、NumPyのナイトリービルドのテストをスキップします（#6973）。
Matplotlibのプレリリース版からのタイトレイアウトに関する警告を無視します（#6976）。
imageioに対する一時的な制約（<2.28）を削除しました（#6980）。

ドキュメント#

draw.polygonとdraw.polygon2maskの境界処理について記述しました（#6690）。
pydata-sphinx-themeのショーケース (#6714).
ビルド環境設定に関する重複した手順をマージしました（#6770）。
skimage.colorモジュールにdocstringを追加しました（#6777）。
DOC:docstring_add_deprecatedのアンダーラインの長さを修正しました（#6778）。
READMEに完全なライセンスへのリンクを追加しました（#6779）。
開発環境設定のためのconda手順を修正しました（#6781）。
skimage.futureモジュールのdocstringを更新しました（#6782）。
READMEから時代遅れのビルド手順を削除しました（#6788）。
transformモジュールにdocstringを追加しました（#6797）。
condaを使用する場合のpipのみの依存関係を処理します（#6806）。
EssentialMatrixTransformクラスとその推定関数に例を追加しました（#6832）。
segmentation.watershedの返されたデータ型を修正 (#6839).
古いdev.pyへの参照をspinで更新する (#6856).
AffineTransformクラスに例を追加しました（#6859）。
_warps_cy.pyxを更新しました（#6867）。
version_switcher.jsonのURLを開発ドキュメントを指すようにする (#6882).
docstringのアンダーラインの長さを修正しました（#6895）。
ギャラリーの例にJupyterLiteボタンを追加しました（#6911）。
area_openingのdocstringのDOIロールに欠けているバッククォートを追加 (#6913).
0.21リリースノートを追加しました（#6925）。
インストール手順ドキュメントを簡素化しました（#6927）。
pydata-sphinx-themeへの移行のフォローアップ (#6933).
リリースノートを更新しました（#6944）。
JupyterLiteのコメントのタイプミスを修正しました（#6945）。
生成されたHTMLドキュメントのロゴをscikit-image.orgに修正しました（#6947）。
リリースノートに不足していたPRを追加しました（#6949）。
CODE_OF_CONDUCT.mdの不正なリンクを修正しました（#6952）。
HTMLドキュメントでGeometricTransform.residualsを公開します（#6968）。

インフラストラクチャ#

pydata-sphinx-themeのショーケース (#6714).
マージキューのためのCI設定を準備しました（#6771）。
devpy 0.1タグに固定しました（#6816）。
バグの問題テンプレートの再現セクションを緩和する (#6825).
devpyの名前をspinに変更する (#6842).
lazy loader 0.2を使用します（#6844）。
ツール内の不要な部分をクリーンアップしました（#6846）。
pre-commitsを更新する (#6870).
PyPIから消えたcodecov依存関係を削除しました（#6887）。
CircleCI APIトークンを追加しました。ビルド済みドキュメントへのステータスリンクを修正しました（#6894）。
一時的にimageioを<2.28にピン留めする (#6909).
リリースノート生成スクリプトにPRリンクを追加しました（#6917）。
公式のmeson-pythonリリースを使用します（#6928）。
HTML出力へのrandom.jsの包含を修正 (#6935).
ランダムギャラリーリンクのURLを修正 (#6937).
SPHINXOPTSを尊重し、spin docsに–install-depsフラグを追加しました（#6940）。
ドキュメントを生成する前にskimageをビルドします（#6946）。
ナイトリーアップストリームホイールに対するテストを有効にしました（#6956）。
ナイトリーホイールビルダーを追加しました（#6957）。
ナイトリーホイールで毎週テストを実行します（#6959）。
CI: 各PRに「type: 」ラベルが存在することを確認します（#6960）。
PRマイルストーンラベラーを追加しました（#6977）。